近年来，潍坊市格外的重视饮用水水源保护，严格依据《山东省饮用水水源保护区管理规定（试行）》等法律和法规要求，落实相关管控措施，2023年，16个县级及以上城镇集中式饮用水水源地水质全部达到Ⅲ类及以上标准。
潍坊强化对水源地保护区规范化建设、关联涉水企业达标情况执法监督，充分的利用三方专家、污染源自动在线监控等手段，组织并且开展全市水生态环境执法专项行动，加强对水源地保护区、企业污水处理设备的检查力度，严厉打击涉水环境违背法律规定的行为，对水源地上游重点涉水企业和污水厂污水处理设备运作情况，先后开展5轮飞行监测和飞行执法，对发现的超标排污等生态环境违背法律规定的行为坚决予以查处，改善全市水生态环境质量和水源地保护区规范化建设水平。鼓励群众对偷排、乱排等现象的举报，建立相应的奖励机制，奖罚结合，防患于未然。
严格落实“划、立、治”三项重点任务，2019年以来每年开展县级及以上集中式饮用水水源地排查整治专项，持续对水源地保护保持高压态势；强化入库河流、水源地水质监测，确保水源水质稳定达标，同时，对全市7个地表型水源地和4条重点入库河流水质开展生物预警监测系统建设，实时监控水源地水质安全，饮用水水源地水质得到保持和改善。以“水量保障、水质合格、监控完备、制度健全”为目标，每年组织全市6个地表水水源地参加国家重要饮用水水源地安全保障达标建设评估并对至少5处省级以上重要饮用水水源地开展市级抽查评估，近三年来峡山水库等6处参评水源地获评优秀等次。
水利部门对列入省级以上重要饮用水水源地名录的35处水源地每月开展1次水质监测，监测结果及时通报市直有关部门和县市区政府，及时预警水源地水质状况，保障水源安全。生态环境部门按照规范要求，定期开展常规监测和水质全分析，每年印发集中式生活饮用水水源地水质监测方案；同时对10个地表型水源地及其上游入库河流安装水质自动在线监测及生物预警系统，建立起24小时实时监测的监控网络，保障水源地安全。同时，除日常取样、徒步、无人机、卫星遥感监测等常规手段外，还积极探索建立饮用水水源保护区智慧监控平台，充分的利用“云上智环”AI分析技术、网络通信技术、云计算等现代化信息技术方法，借助信息化手段实现饮用水水源保护区精细化防控。
强化畜禽养殖污染防治，积极打造畜禽粪污资源化利用新产业，充分的发挥政府在畜禽粪污资源化利用中的引导作用，统筹谋划规划，为培育畜禽粪污资源化利用新产业提供了机制保障和政策支持，引进“山东百德生物印遇龙院士工作站”，推广畜禽粪污资源化利用实用模式。强化化肥减量技术推广，有实际效果的减少化肥用量，大力推广测土配方施肥技术，引导农民科学合理使用化肥，减少化肥用量，各地重点在蔬菜、果树及小麦等作物上建设水肥一体化示范区，并根据水源条件、种植作物、控制面积等因素，选择适宜的水肥一体化技术模式和配套设备，实现田间用水用肥高效化，着力推广有机肥替代化肥。以诸城市绿色种养循环农业试点项目为依托，示范推广畜禽粪便资源化利用为主的有机肥替代化肥，减少实物化肥用量。同时，精选大豆、玉米、花生、小麦、棉花等作物主推技术，精选良种，合理品种搭配，科学肥水调控，适时机械收获。
